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稳定共生的细胞菌群的拓扑结构及实验(抗生素)
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2021-04-18
|
Updated
2022-08-01
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Author:
关莹
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1. 共生系统的模型
1.1. 贝叶斯辅助的拓扑和参数域设计
1.2. GpABC包的学习和改进
1.2.1. 参数域设计案例
1.3. 新共生系统的模型
2. 新共生系统的基础网络设计
2.1. 共生系统的简化设计思路
2.1.1. 选择正交性好,激活区间大的信号感应系统
2.1.2. 选择不重复的启动子和终止子,选择元件所处的质粒骨架
2.1.3. 质粒图谱及合成策略
2.1.3.1. 考虑质粒构建难度
2.1.3.2. 考虑元件表达强度调节难度
2.1.3.3. 序列优化
2.1.3.4. 考虑模型结果优化元件选择
2.2. TOPO3037的质粒设计
2.2.1. 考虑模型结果优化元件选择
2.2.2. 考虑模型结果优化表达量
2.3. 综合分析优化9841和3037
3. 实验设计及结果预测
3.1. 基于上一章的质粒设计,确定质粒的优先级
4. 实验过程
4.1. 质粒构建
5. 附录
5.1. 基因合成片段
5.2. 引物
5.2.2. 设计及实验
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